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GentooはBSD portsに似たPortageと呼ばれるシステムを使用します。PortageはGentooシステムへのソフトウェアのインストールと管理に強力な柔軟性を与えます。コンパイル時のオプションのサポート(USEフラグを利用して)、条件付き依存解決、インストールされる予定のパッケージの概要の表示、ソフトウェアの安全なインストール(sandboxを使用して)、システムのプロファイル、設定ファイルの保護、その他様々な機能を提供します。