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注意が必要なことがあります。emerge --regen には多くの時間がかかります。また、rsync はサーバー側のキャッシュを使ってキャッシュを更新するため、rsync を使っている場合にはこれは推奨されません(portage ユーザーのほとんどは rsync を使用しています)。rsync のユーザーは、キャッシュを再生成したい場合は単に emaint (または eix-sync) を使用してください。おそらく、emerge --regen を試す必要があるのは非常に巨大な ebuild リポジトリのユーザーだけです。