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Pacotes não são "armazenados". Em vez disso, o Gentoo provê um conjunto de scripts que pode resolver dependências, baixar o código fonte e compilar uma versão de um pacote específica para as necessidades do usuário. Geralmente o Gentoo apenas cria binários para lançamentos e snapshots. O Manual do Desenvolvedor Gentoo aborda o conteúdo de um script ebuild em detalhes.