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Um das System in perfekter Form zu halten (und ganz zu schweigen von der Installation der neuesten Sicherheitsupdates), ist es notwendig, das System regelmäßig zu aktualisieren. Da Portage nur die Ebuilds im Gentoo-Repositorium prüft, ist das erste was zu tun ist, dieses Repositorium zu aktualisieren. Wenn das Gentoo-Repositorium aktualisiert ist, kann das System mit aktualisiert werden. Im nächsten Beispiel wird auch die  Option verwendet, die Portage anweist, die Liste der Pakete, die es aktualisieren möchte, anzuzeigen und um Bestätigung zu bitten: