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Por defecto en Gentoo se puede construir el sistema completo desde el código fuente utilizando las opciones de optimización que elija el usuario. Éste tiene completo control sobre los paquetes que se instalan y los que no. Gentoo proporciona numerosas opciones, de manera tal que se pueda instalar Gentoo a gusto del usuario, razón por la que a Gentoo se la conoce como una metadistribución.