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Um Gentoo zu optimieren, können Variablen gesetzt werden, mit denen das Verhalten von Portage (Gentoos offiziellem Paket-Manager) beeinflusst wird. Diese Variablen können als Umgebungs-Variablen gesetzt werden (mit ), aber diese wären nicht permanent. Um die Variablen permament zu setzen, können sie in definiert werden. make.conf ist eine Portage Konfigurationsdatei, die von den Portage Tools beim Start eingelesen wird.